MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017780	ACC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859193
2	NC_017780	ATTAGT	2	12	389	400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386859193
3	NC_017780	CTG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859193
4	NC_017780	ATC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859193
5	NC_017780	AGC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859193
6	NC_017780	ACC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859194
7	NC_017780	TAGC	2	8	647	654	25 %	25 %	25 %	25 %	386859194
8	NC_017780	CTG	2	6	738	743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859194
9	NC_017780	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859194
10	NC_017780	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859194
11	NC_017780	T	6	6	847	852	0 %	100 %	0 %	0 %	386859194
12	NC_017780	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859194
13	NC_017780	T	6	6	1454	1459	0 %	100 %	0 %	0 %	386859195
14	NC_017780	TTC	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
15	NC_017780	TCT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
16	NC_017780	CTG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
17	NC_017780	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
18	NC_017780	CTG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
19	NC_017780	TGC	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
20	NC_017780	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
21	NC_017780	CCT	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
22	NC_017780	GAAA	2	8	1729	1736	75 %	0 %	25 %	0 %	386859195
23	NC_017780	TTCC	2	8	1813	1820	0 %	50 %	0 %	50 %	386859195
24	NC_017780	CTG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
25	NC_017780	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859195
26	NC_017780	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
27	NC_017780	TTA	2	6	1913	1918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
28	NC_017780	TTTC	2	8	1971	1978	0 %	75 %	0 %	25 %	386859195
29	NC_017780	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
30	NC_017780	TAA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859195
31	NC_017780	CTG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
32	NC_017780	GCA	3	9	2054	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
33	NC_017780	CTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
34	NC_017780	CTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
35	NC_017780	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
36	NC_017780	TAC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
37	NC_017780	TTA	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
38	NC_017780	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
39	NC_017780	AGT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
40	NC_017780	A	6	6	2361	2366	100 %	0 %	0 %	0 %	386859195
41	NC_017780	CAG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
42	NC_017780	TCC	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
43	NC_017780	TCC	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
44	NC_017780	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
45	NC_017780	TTAC	2	8	4454	4461	25 %	50 %	0 %	25 %	386859196
46	NC_017780	A	7	7	4494	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	386859196
47	NC_017780	ATA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
48	NC_017780	TAATTT	2	12	4544	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
49	NC_017780	TTA	2	6	4587	4592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
50	NC_017780	TCTAT	2	10	4614	4623	20 %	60 %	0 %	20 %	386859196
51	NC_017780	TAA	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
52	NC_017780	TTC	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859196
53	NC_017780	T	6	6	4651	4656	0 %	100 %	0 %	0 %	386859196
54	NC_017780	TAAG	2	8	4713	4720	50 %	25 %	25 %	0 %	386859196
55	NC_017780	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859196
56	NC_017780	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
57	NC_017780	TAA	2	6	4780	4785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
58	NC_017780	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	386859196
59	NC_017780	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
60	NC_017780	T	6	6	7024	7029	0 %	100 %	0 %	0 %	386859197
61	NC_017780	AAC	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859197
62	NC_017780	TGA	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859197
63	NC_017780	T	7	7	7138	7144	0 %	100 %	0 %	0 %	386859197
64	NC_017780	ATTT	2	8	7146	7153	25 %	75 %	0 %	0 %	386859197
65	NC_017780	AATTA	2	10	7177	7186	60 %	40 %	0 %	0 %	386859197
66	NC_017780	TA	3	6	7213	7218	50 %	50 %	0 %	0 %	386859197
67	NC_017780	TCT	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
68	NC_017780	CTT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
69	NC_017780	TAAA	2	8	7261	7268	75 %	25 %	0 %	0 %	386859197
70	NC_017780	CTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
71	NC_017780	TAT	2	6	7347	7352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
72	NC_017780	CTAT	2	8	7379	7386	25 %	50 %	0 %	25 %	386859197
73	NC_017780	TTTCT	2	10	7398	7407	0 %	80 %	0 %	20 %	386859197
74	NC_017780	TAA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859197
75	NC_017780	TTC	2	6	7456	7461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
76	NC_017780	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859197
77	NC_017780	TCA	3	9	7481	7489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859197
78	NC_017780	TCT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
79	NC_017780	CT	3	6	7512	7517	0 %	50 %	0 %	50 %	386859197
80	NC_017780	AATTT	2	10	7523	7532	40 %	60 %	0 %	0 %	386859197
81	NC_017780	AGT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
82	NC_017780	TCAAA	2	10	7682	7691	60 %	20 %	0 %	20 %	386859198
83	NC_017780	T	7	7	7709	7715	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
84	NC_017780	CT	3	6	7725	7730	0 %	50 %	0 %	50 %	386859198
85	NC_017780	A	6	6	7747	7752	100 %	0 %	0 %	0 %	386859198
86	NC_017780	T	6	6	7755	7760	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
87	NC_017780	TAA	2	6	7776	7781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
88	NC_017780	T	8	8	7798	7805	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
89	NC_017780	T	6	6	7848	7853	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
90	NC_017780	ATT	2	6	7978	7983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
91	NC_017780	TCTT	2	8	8139	8146	0 %	75 %	0 %	25 %	386859198
92	NC_017780	TA	4	8	8156	8163	50 %	50 %	0 %	0 %	386859198
93	NC_017780	TTAC	2	8	8167	8174	25 %	50 %	0 %	25 %	386859198
94	NC_017780	GTA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
95	NC_017780	TG	3	6	8230	8235	0 %	50 %	50 %	0 %	386859198
96	NC_017780	TATC	2	8	8240	8247	25 %	50 %	0 %	25 %	386859198
97	NC_017780	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
98	NC_017780	T	6	6	8262	8267	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
99	NC_017780	TTA	2	6	8336	8341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
100	NC_017780	T	6	6	8349	8354	0 %	100 %	0 %	0 %	386859198
101	NC_017780	ATC	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859199
102	NC_017780	GTTT	2	8	8387	8394	0 %	75 %	25 %	0 %	386859199
103	NC_017780	TAA	2	6	8415	8420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859199
104	NC_017780	A	7	7	8419	8425	100 %	0 %	0 %	0 %	386859199
105	NC_017780	TCT	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859199
106	NC_017780	T	8	8	8462	8469	0 %	100 %	0 %	0 %	386859199
107	NC_017780	AGT	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859199
108	NC_017780	TATG	2	8	13349	13356	25 %	50 %	25 %	0 %	386859200
109	NC_017780	ATC	2	6	13364	13369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859200
110	NC_017780	TAT	2	6	13430	13435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
111	NC_017780	A	6	6	13437	13442	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
112	NC_017780	TGA	2	6	13448	13453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
113	NC_017780	GGA	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859200
114	NC_017780	AG	3	6	13594	13599	50 %	0 %	50 %	0 %	386859200
115	NC_017780	A	6	6	13633	13638	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
116	NC_017780	AGA	2	6	13643	13648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
117	NC_017780	AT	3	6	13718	13723	50 %	50 %	0 %	0 %	386859200
118	NC_017780	ATT	2	6	13795	13800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
119	NC_017780	GAT	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
120	NC_017780	ATA	2	6	13993	13998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
121	NC_017780	GTT	2	6	14012	14017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859200
122	NC_017780	A	8	8	14048	14055	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
123	NC_017780	AGA	2	6	14060	14065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
124	NC_017780	A	6	6	14150	14155	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
125	NC_017780	TGA	2	6	14177	14182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
126	NC_017780	ATT	2	6	14262	14267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
127	NC_017780	TGATAA	2	12	14282	14293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386859200
128	NC_017780	GAAAC	2	10	14384	14393	60 %	0 %	20 %	20 %	386859200
129	NC_017780	TAA	2	6	14417	14422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
130	NC_017780	AGA	2	6	14479	14484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
131	NC_017780	A	6	6	14489	14494	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
132	NC_017780	AAG	2	6	14568	14573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
133	NC_017780	A	6	6	14579	14584	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
134	NC_017780	TGT	2	6	14596	14601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859200
135	NC_017780	A	6	6	14630	14635	100 %	0 %	0 %	0 %	386859200
136	NC_017780	AAT	2	6	14640	14645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.